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行業新聞

近日,家畜營養與調控科技創新團隊利用16s rDNA測序技術研究豬腸道菌群的空間分布情況,揭示腸黏膜與腸腔、不同腸段微生物種屬水平及功能組成的異質性,建立不同“生態位”上的菌群共生網絡。

  該研究描繪豬腸腔內菌群的空間分布,發現回腸與盲、結腸之間,腸腔與腸黏膜微生物之間的顯著差異。通過SparCC共線性網絡分析發現普雷沃式菌科、毛螺菌科以及韋榮氏球菌科在腸腔和腸黏膜微生物上都形成共現性微生物菌群,而來自于γ-變形菌門中機會性致病菌則僅在豬腸道黏膜上形成共現性微生物菌群。腸腔中腸桿菌科和以普雷沃式科為中心的菌群形成強的共排斥關系;冗余分析發現膽汁酸(37.1%)以及短鏈脂肪酸(41%)組成能解釋腸腔微生物組成中51%的變化。部分核心菌群參與宿主必需氨基酸、能量、輔酶因子和維生素的代謝。結果表明豬腸道菌群空間分布的異質性以及共生模式是與其所在“生態位”的微環境緊密相關;核心微生物之間的互作對宿主腸道代謝和免疫發揮著重要作用。該成果可為靶向性的調控腸道菌群改善腸道健康提供重要的理論依據。

  該研究成果以《生長豬腸腔微生物和腸黏膜微生物的空間分布異質性以及共現性網絡分析》為題發表于著名期刊《微生物學前沿(Frontiers in Microbiology)》2018年1月第9卷。中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所為第一完成單位,博士生張莉為第一作者,解競靜副研究員和張宏福研究員為通訊作者。


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